現在win2000を使用していますが、一定の時間になれば自動でアプリが起動するツールは無いでしょうか？また、その際にwin自体の電源をオートで入れる事は可能なのでしょうか？

電源をAUTOで入れるにはBIOSにその機能が備わっていないと無理みたいです。シャットダウンはできますけど。

タスクスケジューラの説明が豊富です。ここを読めば、アプリを規定の時刻に起動させるご要望は可能かと思います。

アプリケーションの起動については、

[スタート] - [設定] - [コントロールパネル] - [タスク]

で、できるかと思います。

上記URLはWindows 2000 Server向けの情報となっていますが、Professionalでもいっしょです。

電源投入はできませんが、trascheで時間でアプリを起動できます。データファイルの指定でも、関連づけられたアプリが起動します。また、これとは別に、windowsのdosプロンプトのatコマンドでスケジュールの予約ができます。