http://www2.starcat.ne.jp/~kanocl/shumi/mondomanual.htm
manual of mondoarchive
>Linux以外のファイルシステムでさえ、CD・テープ・ISOイメージ・NFSマウントにバックアップすることができます。
http://www2.starcat.ne.jp/~kanocl/shumi/mondohowto.htm
Mondo Rescue と Mindi Linux
>ブート・セクターを含めてLinux/Windows システムをバックアップできます。
>Mindi Linuxは、あなたのLinux distroで、あなたが基礎的なシステム保守を実行することのできるブート/ルートのフロッピーディスクイメージのセットを作ります。
>Mindiのブートディスクの主な長所は、そのブートディスクがあなたのカーネル、モジュール、ツールとライブラリを含んでいるということです。
自分で使用したことはないのですが、これなら「WindowsOSのみがインストールされたマシンのバックアップ」は可能でしょう。
ということで、Mindi Linuxをお勧めしておきます。
ちなみに下記は、紹介のTOPページです。
http://www2.starcat.ne.jp/~kanocl/shumi/mondotop.htm
Mondo Rescue と Mindi Linux の紹介
ブートセクターを含めてWindowsOSもバックアップできますが、Linuxシステムがインストールされていることが前提と説明されています。
mindiはインストールされているカーネルを使ってブータブルCDを作成するツールです。