「分子（水素だったか？）の形状の角度で有機質と無機質を分ける。120°（数字もうろ覚え）が２つの妥協的角度。」という情報を雑誌で読んだような気がします。唐突に思い出してなぜか気になって仕方ありません。お詳しい方お教えいただけませんでしょうか？お願いいたします。

こちらはどうですか。

有機化合物とは「（炭素原子）を骨格とする構造を持つ化合物」と定義

する。ただし二酸化炭素 ＣＯ2 や炭酸カルシウム ＣａＣＯ3 のような物質は除かれる。

ということです。

学校でもそう習いますし角度は関係ないと思われます。

メタンの分子は炭素原子に４つの水素原子がついてできていますが

その形は正４面体になるため水素-炭素-水素の結合のなす角度が109.5度となります

メタン以外でも炭素原子の周りに４個の原子がつく場合はこの角度に近い数字になります。

この数字がご質問の120度に近いのですが

「妥協的角度」とは関係ないと思います。