Debian GNU/Linux(woody)でEximを使っていますが、他のMTA(sendmail以外)の例でも構いません。
直接解決に結びついた回答には高ポイント進呈します。
No.1
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http://www.kobitosan.net/postfix/
Postfixのぺーじ−ホーム
postfix へ移行されるというのはどうでしょうか。
ご希望のような動作もこのページの７３番で可能です。
No.2
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http://www.itmedia.co.jp/help/tips/linux/l0530.html
ITmedia エンタープライズ : Linux Tips「Postfixで特定拡張子の添付ファイルを拒否させたい」
Postfixでの例ですが…。
No.3
37798
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幾つか方法はあります．
MTAに依存しない方法としては，
procmail を使う方法が一般的だと思います．
上記URLに「やばそうなファイル (実行可能ファイル等) が添付されていたらとりあえず捨ててしまうレシピ」が掲載されています．
~/.forward から procmail を起動するようにして，上記レシピ（メールを捨てるルール）を設定するだけです．
MTAとして postfix を使っている場合は，
postfix側で同じようなことが出来ます．
また蛇足な気もしますが，ウイルス付きのスクリーンセーバや，zipファイルを除去するのが目的ならば procmail と spamassassin を組合わせる方法がオススメです．
ありがとうございます。
そういえばprocmailがありましたね。
サンプルはみんなpostfixですねぇ。exim捨てるか。
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うーん、やっぱりpostfixかなぁ。
稼動数と情報量が違いますね。