ＦＣ展開をする際に契約書を交わすのだが、自社のオリジナルの契約書ではなく、ほか弁の契約書を勝手に運用していた。今回それがほか弁にわかってしまい本日先方と会うことになっている。契約書を勝手に使うとどんなことで指摘がいうるのか？法的問題は何かありますか？

不正競争防止法

結構深刻な問題になる可能性があります。
流用した契約書の入手先によって展開が異なります。
あなたが以前「ほか弁」のＦＣ加盟店だったことがあって、その後離脱して新しいＦＣを自分で立ち上げて、加盟店を募集していたとしたらかなりやっかいです。法的手段をとられて、「ほか弁」の逸失利益につき損害賠償請求される恐れがあります。
早急に弁護士に相談されることをお勧めします。

http://www.ipa.go.jp/security/fy10/contents/crack/research/law/Criminal-3.html

Ｒｅ：

凄いことになってるのに、ほか弁というギャップが凄いです。「バカにしてんのか！」とか、大問題にならないことをお祈りします。