ポリペプチド鎖を、α鎖、β鎖、γ鎖などと区別することがありますが、このギリシャ文字の意味は何でしょうか? 例えばT細胞レセプターはα鎖、β鎖、γ鎖、δ鎖からなりますが、MHC拘束性のあるのはα鎖、β鎖からなるαβ型です。また、CD3は、γ、δ、ε、ζ鎖からなります。ポリペプチド鎖の高次構造にαヘリックス、βシートというのがありますがそれと関係あるのでしょうか? その場合、γとかδというのは構造的に何かあるのでしょうか?

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回答(3件)

id:blizzard197101 No.1

blizzard197101回答回数149ベストアンサー獲得回数02005/04/12 13:37:05

ポイント20pt

生化学は疎いのですが…。


普通、カルボニル基に隣接する炭素のうち、カルボニル基に近いほうから、それぞれα位、β位、γ位炭素…というふうに呼びます。


要は、考慮している官能基(もしくは鎖)が、ペプチド結合内のカルボニル基に対してどの場所に結合しているか、を表しているのではないでしょうか?

いわゆるαへリックス構造とか、βシート構造、というのは、また違う話のような気がしますが。

誰か詳しい人の回答を待ちます。

id:FK506 No.2

FK506回答回数99ベストアンサー獲得回数102005/04/12 21:19:13

ポイント20pt

http://www.hatena.ne.jp/1113271242#

人力検索はてな - ポリペプチド鎖を、α鎖、β鎖、γ鎖などと区別することがありますが、このギリシャ文字の意味は何でしょうか? 例えばT細胞レセプターはα鎖、β鎖、γ鎖、δ鎖からなり..

端的に答えると、意味はあまりないと思いますが、アルファベットでつけると間際らしいからギリシャ文字を使うようにしているだけだと思います。同じ複合体ないにあるサブユニットをわかりやすく表示するためや同じ機能をもった酵素群を分類するためにギリシャ文字はよく使われます。たとえばDNAポリメラーゼはαからζまで機能ごとに分類されていいます。αヘリックス、βシートとγとかδというのはまったく関係ありません。

id:toshiro7

 要するに適当である、ということでしょうか? 免疫グロブリンファミリーは抗体のポリペプチド鎖を、H鎖についてはα鎖=IgA(のH鎖、以下同様)、γ鎖=IgG、δ鎖=IgD、ε鎖=IgE、μ鎖=IgMと呼びますから、それらと構造的な相同性がある場合、α鎖、γ鎖、..と呼ぶのかと思ったことがありましたが(β鎖というのが命名できないのはおかしいですしね)、どうもそうではなさそうです。TCRについてはα、β、γ、δ鎖があり、これと複合体をなしているCD3はγ、δ、ε、ζ鎖から成ります。CD3にはα、β鎖はないの? と疑問が生じました。これについて想像ですが、以下のシナリオが考えられました:TCRは最初α、β鎖しか知られていなかった。TCR/CD3複合体を示すのに、TCRのα、β鎖(のギリシャ語)に続けて、CD3のペプチド鎖はγ、δ、ε、ζ鎖とした。ところがその後TCRにバリエーションが見つかり、それらをγ、δ鎖とした。従って、TCRにα、β鎖しか知られていなかったときはTCR/CD3複合体のγ鎖といえばCD3のγ鎖と分かったが、現在はTCRにもCD3にもγ鎖があるため、どちらのγ鎖か言わなければ紛らわしい。

2005/04/14 19:16:16
id:FK506 No.3

FK506回答回数99ベストアンサー獲得回数102005/04/14 22:52:43

ポイント20pt

H鎖のα鎖=IgA、γ鎖=IgG、δ鎖=IgD、ε鎖=IgE、μ鎖=IgMのギリシャ文字はIgAのAに対応しているだけだと思いますが、そもそも、なぜIgAという名前がついたかは、抗体の発見の歴史を見てみないとわからないかもしれません。単純に発見した順番かもしれません。ちなみに上記ホームページによるとIgB(Igbeta)というものも存在するらしいですが、これはほとんど抗体というよりレセプターですね。おそらく、グロブリンは電気泳動や免疫学的性質によって発見分類されてきたと思うので、はじめは発見した順にアルファベット順にずっとあったのかもしれませんが、抗体と構造があまりに違うものは消えていったのかもしれません。たんぱく質が発見された後に、利根川進の発見により一つの抗体に対して遺伝子が複数あることがわかったので、遺伝子名にそのままたんぱく質の名前を当てはめると数が違いすぎるので、それぞれの抗体のアルファベットをギリシャ文字に置き換えて、さらに番号を振り分けることによって、抗体の遺伝子を表記するようにしたのではないでしょうか?CDレセプターについてはよくわかりませんが、これも免疫学的分類と遺伝子の多様性が名前に影響を与えている気がします。染色体上にはアルファベット順に遺伝子があるのかもしれませんが、実際には発現してなかったり、偽遺伝子だったりして、たんぱく質の名前が抜けていたりするのではないでしょうかね。

id:toshiro7

抗体の命名履歴にちょっと興味を覚えましたがペプチド鎖のギリシャ語のテーマとちょっと違うので一旦質問終了いたします。どうもありがとうございました。

2005/04/17 16:40:20

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