フリーでも結構使えるものが、ありますよ。
Nzp
2/3次元グラフ作成ソフト
満足しました。
http://www.jip.co.jp/si/soft/mathematica/data.html
Mathematicaとは?
ちゃんとしたものがお好みなら、Mathematica を使うのが良いかと思います。
それほど大した用事じゃないです。
http://www.ganaware.jp/archives/2005/05/mac_os_x_tiger.html
Mac OS X Tiger : Grapher (GANAware)
無料です。
mac版ですが。
Mac は4年ほど縁遠くなっております。
初心者がちょっと使うだけなので、いささか大げさという印象が。