LivedoorBlogで各エントリーのページを表示する際に、トラックバックやコメントを別ページで開くように設定する事はできるのでしょうか？

blog topページからコメントへのリンクをクリックした時に、別窓で記事個別ページのコメント部分を画面に表示することはできます。

デザインの設定→カスタマイズにてトップページのHTMLの編集を行います。

href=”<$ArticlePermalink$>#comments”

の部分を

href=”<$ArticlePermalink$>#comments” target=”_blank”

として保存、インデックスの再構築を行ってください。

トラックバックは

href=”<$ArticlePermalink$>#trackback”の部分を同様に変更します。

HTML編集についてはURLのサイトなどを参考になさってください。

記事個別ページのコメント部分を分割して別窓にする方法(goo blogの様な)は思いつきません。コメントのみのHTMLファイルが用意されていないと思われ構造上無理な気がします。