染色体のある部位に乗っている同定されている遺伝子をリストアップする方法を教えてください。(例えば9q12.1に乗っている遺伝子全部などというように)。リストアップされた遺伝子名をクリックすると、その遺伝子の機能などがリンクされている形ならさらにうれしいです。

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回答(4件)

id:kaminoitte No.1

kaminoitte回答回数254ベストアンサー獲得回数02005/11/12 14:43:20

ポイント10pt

ヒトゲノムのことですか?

ここのDNA データバンク (ヒト染色体地図) をクリックしてみてください。

id:takezonaze

これは教育用のもので、例えば12番染色体をクリックしてもわずか3つの遺伝子しか表示されません。ある部位にある「すべての遺伝子」を探しています。

2005/11/12 15:12:13
id:kaminoitte No.2

kaminoitte回答回数254ベストアンサー獲得回数02005/11/12 15:20:47

ポイント10pt

解読されたゲノムは、NCBIやUCSC、及びSanger Centerなどの研究機関で参照することができる。


ヒトゲノムでいいんですよね?

だったら全部のゲノムが解析されてるのでここに書いてあるサイトで閲覧できるようですよ。

NCBIのオフィシャルサイト

id:takezonaze

ありがとうございます。ヒトゲノムです。もちろんNCBIやEnsembleなどは時々覗いているのですが、例えば9q12.1に乗っている遺伝子をリストアップする方法がわからないのです。研究に関しては初心者なもので、よろしくお願いします。

2005/11/12 15:33:29
id:kurasinokoizumi No.3

kurasinokoizumi回答回数106ベストアンサー獲得回数02005/11/12 17:05:16

ポイント10pt

バンクより本をみた方が楽ですよ。

全部リストアップするより代表的な者を上げ、あとペーパーで新しいのを検索する。

id:takezonaze

ありがとうございます。今回はある疾患の新規責任遺伝子を探す研究をするかどうか迷っていて、その疾患の責任遺伝子領域がかなり狭い範囲まで絞り込まれています。そこに存在する遺伝子の数がもし非常に少ないのなら、その各遺伝子により作られる蛋白の機能の情報やノックアウトマウスのデータから、候補責任遺伝子をリストアップできないかどうか考えているところなのです。

2005/11/12 19:07:10
id:KIYO No.4

KIYO回答回数9ベストアンサー獲得回数02005/11/12 17:32:38

ポイント100pt

NCBIのサイトをご覧になられているそうですので、既知かもしれませんがそうでしたらポイントは不要です。


ゲノム上の遺伝子を調べる方法ですが、上記サイトで各染色体上に存在する遺伝子がリストアップされています。


実際は数多くの遺伝子が存在するはずですが、染色体全体の地図ですと代表的な遺伝子しかリストアップされていません。


9番染色体ということで、9をクリックすると既知・未知の遺伝子含めて20個しかリストアップされません。


例として挙げられている9q12.1に存在する遺伝子を調べたい場合、赤字のGenes_seqの下にある線にカーソルを合わせてクリックするとズーム倍率が選べますし、見やすいようにRecenterで中心位置を変えていけば、目的の染色体上の遺伝子が表示されます。

9q12付近を拡大したものです。


画面一番左のRegion Shownで58M~68Mまでの10Mbpを選びました。ここの数値を変更することでより細かい範囲も設定できます。


あとは表示されたリンク先に行けばその遺伝子の詳細な情報が判明すると思います。


こうして見ると9q12上の遺伝子は未知のものが多そうですね。ダイヤモンドの原石が見つかるといいですね。

id:takezonaze

 ありがとうございます。このページを探していました。きちんと探していこうと思っても、英語の壁で苦労していました。英語の不勉強を痛感しています。研究は超初心者ですが、がんばってみようと思います。

2005/11/12 19:11:20

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