ブログでムーバブルタイプくらいの機能があり、日本語に対応している無料で使えるお勧めはありますでしょうか？商用利用ができるものでお願いします。 自社のサーバーにインストールするタイプでお願いします。（FC２やライブドア、XREA等は対象外になります。）

ワードプレスが一般的かと。日本語にも対応してます。

http://wordpress.xwd.jp/

ムーバブルタイプが窮屈で乗り換える人も多いですよ。

テーマ（スキン）も豊富です。

http://wordpress.org/extend/themes/

こちらのシステムはいかがでしょうか？

http://www.web-liberty.net/

Web Diary Pro　はかなり使えそうです。

商用利用については，こちらのページをお読みください。

http://www.web-liberty.net/info/regist.html

WordPressはどうでしょうか。

php+MySQLです。

http://wordpress.xwd.jp/

フリーなブログツールとしては

Drupal

http://drupal.org/

http://drupal-jbox.net/

Wordpress

http://wordpress.org/

http://wordpress.xwd.jp/

Nucleus CMS

http://www.nucleuscms.org/

http://japan.nucleuscms.org/

あたりが比較的よく知られていると思います。

Drupalは、MT互換を目指しているといった話もあるようです。Wordpressは最近入門書も刊行されました。NucleusはCMSがついていますが、実質通常のブログツールです。

ひっかかり（坂本龍一のブログ）

http://blog.sitesakamoto.com/

などは Nucleusを使っていることで有名ですよね。ネット上の日本語情報は、上記2つ以上に多いと思います。