とある遺伝子の研究のためバイサルファイトシークエンスをしていますが、実際の領域の配列と、シークエンス結果との照らし合わせ方がわかりません。

シークエンスはABI310を使用しています。
分子生物の知識ゼロでもわかりやすいサイト、あるいは教えてくださる方がいましたらお願いします。

回答の条件
  • 1人2回まで
  • 登録:2006/09/08 19:58:38
  • 終了:2006/09/09 16:23:41

回答(2件)

id:sterna No.1

arakai回答回数267ベストアンサー獲得回数62006/09/08 20:38:12

ポイント35pt

バイサルファイトシークエンスとは良く知りませんが、

ClustalXで、普通にアラインメントをするのではだめでしょうか?

使用方法は以下のとおり。

http://w3pharm.u-shizuoka-ken.ac.jp/~bisei/text/research/Gen...

http://bips.u-strasbg.fr/fr/Documentation/ClustalX/

実際の配列はDDBJなどで検索してください。

http://www.ddbj.nig.ac.jp/

id:reje55 No.2

reje55回答回数90ベストアンサー獲得回数32006/09/08 23:30:02

ポイント35pt

同じ研究室の方にオススメのソフト等を含めて聞くのが

手っ取り早いと思うのですが・・・。


・アライメントとは

http://weblearningplaza.jst.go.jp/cgi-bin/user/top.pl?next=C...

このサイトの「バイオインフォマティクス-配列解析手法の原理」などを参照してください。


遺伝子のアライメントが出来るソフトはたくさんあります。

研究室で採用されているものを使用してみてはいかがでしょう?

Windowsのフリーの遺伝子解析ソフトというものが存在します。


BioEdit

http://cse.fra.affrc.go.jp/ksaitoh/BioEditTutorial.html

こちらなどを参考にしてください。

  • id:shinlly
    どうもありがとうございました。最近研究室も人がいなくて、単独でやっているため、聞くことも出来ず、実験がすすみませんでした。ご紹介いただいたサイトでがんばってみます。

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