【100ポイント】 MacとLinuxのプログラミングに関する質問です。回答を頂けなかったのでポイントをアップしました。最も参考になる回答をしてくださった方（1名様）に100ポイントを進呈します。

Mac OS X では AppKit の機能の一部として実装されていますので、すべての Cocoa アプリケーションでマウスイベントをハンドルできます。

http://developer.apple.com/documentation/Cocoa/Conceptual/EventO...

こちらは、ハンドルできるマウスイベントの種類について記述されています。マウスのボタンダウン、ボタンリリース、ドラッグ、移動の４つがあります。

http://developer.apple.com/documentation/Cocoa/Conceptual/EventO...

こちらでは、イベントのディスパッチの動作について、簡単な説明が記述されています。

Carbon アプリケーションの場合は以下のようになります。

http://developer.apple.com/documentation/Carbon/Conceptual/Carbo...

CarbonアプリでEventManagerを使ったプログラミングについては以下のpdfが参考になります。

http://developer.apple.com/documentation/Carbon/Conceptual/Carbo...

　kimbaraさんの紹介されている方法はグローバルフックとは性格が異なるのではないかと。MacOSXでアプリケーション/ウィンドウのイベントを横取りする方法としては，Objective-Cの動的バインドの特長を利用して，自前のクラスをフレームワークのクラスと置き換える方法があるようです。その為の方法ではないので変更が衝突した場合の動作に不安が残りますが...。

http://www.cocoadev.com/index.pl?GlobalModifications

http://www.cocoadev.com/index.pl?WindowShade