.htaccessの設定を下記のようにすると、/で終わるURLを入力すると、ブラウザでうまく表示できず、『ファイルのダウンロード－セキュリティの警告』ウインドが出てしまいます。/index.htm まで入力するときちんと表示できます。/で終わっても正常に表示させるにはどうすればよいでしょうか

再現できなかったのでなんなんですが、

index.htm内容は、単純な文字列表示

<?php echo "test";?>

などで試してみても、そうなるんでしょうか？

PHP側で、headerをどうにかしたら、どうにかなりませんかね…？

http://www.spencernetwork.org/memo/tips-5.php

phpがApacheのモジュールとして実装されている場合であれば、

　　DirectoryIndex index.htm
　　AddType application/x-httpd-php .htm

の２行だけで済むはずなのですが、

　　Options +ExecCGI
　　AddType text/html cgi
　　AddHandler cgi-script cgi

の３行が附加されているということは、

phpをCGIとして実装しているサーバーなのでしょうか？

モジュール版phpは、どのディレクトリでも設置・利用可能なので、

うしろの３行は不要なのでphpinfoで確認してみてください。

（モジュール版とCGI版では使える関数や動作が異なる場合があるので、

今後のためにも把握しておいてください））

確認方法は

　　<?php  phpinfo()  ?>

という１行だけのファイルを作って、適当な名前でアップロードし、

ブラウザでアクセスすればサーバーの情報が丸見えになります。

丸見えになりますので、誤って使わないように、使ったあとは直に消してください。

本題に戻りますが、怪しいと思うところは、

　　Options Includes

です。

Apacheの既定ファイル（httpd.conf）上のOptionsを無視するのではなく

　　Options +Includes

に変えることによって対応できるかもしれません。

余談ですが、

　　Options +Includes +ExecCGI

のように一行に書けますよ。

http://httpd.apache.org/docs/2.0/ja/howto/htaccess.html

CGI版で、問題の症状ならば、下記が参考になるかもしれません。

さくらインターネット

http://faq.sakura.ne.jp/wiki/wiki.cgi?cgi%A4%C8php#i24

/usr/local/bin/phpを~/www/somewhereにphp.cgiという名前でコピーして、実行権を付けておく。

↑にてphpの本体を自分の支配下にコピーして↓にてプログラムとして割り当てます。

AddHandler myphp-script .htm
Action myphp-script /somewhere/php.cgi

※/somewhereというディレクトリ名は適当に変えてください。

一人２回までなので、とりあえず一旦これにて失礼します。

（回数を増やしていただくか、コメント欄を利用可能にしておいていただければ、出来うる範囲ですが追従します。）