http://www3.ocn.ne.jp/~uri-o313/yumesato/tag/4/i-frame.htm

追記ですが、Internet Explorer のセキュリティレベルを
見たらカスタマイズ状態になっており、規定の「中」に直したところ
iframe の中身が読み込まれました。「高」にしたところまた開かなくなり
「中」にしたところまた読み込まれました。

どうやら質問をした段階で、「中」レベルのどこかの値がカスタマイズされ、
iframe の中身を読み込まないようになっていたようです。

この後に回答してくださる方は、どの設定値が HTML の読み込みに関連しているかを
はっきりさせていただくのがこの質問の答えになると思います。

＃ちなみに、「iframe 内のプログラムの起動設定」は、
質問の段階で「ダイアログを表示する」でした。

> 自サイト(自ドメイン)内のページを開くのでしたら設定にかかわらず開けるはずです。

なぜか、同じサイトのページも開きませんね。
再度質問を立て直したほうがいいんだろうか。

どうやら、同じドメイン内でも開けないようですね。
http://www.tagindex.com/cgi-lib/q2bbs/patio.cgi?mode=view&no=1552
JavaScript で代替するしかないかもですね。

私が試した限りでは自ドメイン内では問題ありませんでした。
IEのバージョンで挙動が違うとか別の原因があるのかもしれません（汗

JavaScript で実装することで、あっさり解決できました。
http://labs.spicebox.jp/p/channel_maker/
まあ HTML では原則この挙動はNGということでしょうかね。