Vistaのノートブックですが、終了したと思ってかばんにしまっても、終了してなくて、筐体の温度が上がってしまったりして困ることがあります。これを避けるにはどうしたらよいでしょうか。

それは、シャットダウンしたことをしっかり確認してからしまうしかないでしょう。

私のパソコン（WindowsXP）でも同様の症状が発生することがあります。

きちんと電源が落ちるまで鞄へしまったりしてはいけません。

終了作業中はHDが稼働しているので、不用意に動かしたりして振動を与えたりすると、ヘッドとディスクが接触し磁気面を壊します。

データも壊れるならディスクの表面も傷ついて不良セクタになります。

もちろん普段の作業中も同様です。

コンピューターを扱う上での常識なんだけど、分かってない人が非常に多いようで、、

また、筐体を閉じる事によりサスペンドなどへ移行してしまうので、そういう点でも終了作業が正常に進まないのかもしれません。

チェックディスクをフルオプションでやってみるべきですね。

（かろうじて読めていたファイルも読めなくなったりする事があるみたいだけど、、）