携帯サイトを構築しているのですが、
テンプレートをEUC-JPで作成して
出力する際に、
mb_convert_encoding($data,'SJIS', 'EUC-JP' );
という形で、EUC-JPのデータをShift-Jisに変換してます。

以下のサイトで文法チェックをすると
点数がすごく低いし、内容が文字化けしちゃいます。
http://htmllint.itc.keio.ac.jp/htmllint/htmllint.html

やはりこういうチェックもきちんとしてある程度の点数は
欲しいと思っているのですが、どうしたらいいでしょうか？

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文字化けしているって事はヘッダ情報がShift-JISになってないんじゃ・・・

点数が低いのは一つずつ地道につぶすしかないです。

有る段階から一気にあがるのでがんばりましょう

23pt

Content-Type指定をmetaタグでするのはあくまで次善手段で、本来はちゃんと Content-Type"ヘッダー" で指定するべきかと思います。

phpなら↓こうですね。

header("Content-Type: text/html; charset=Shift_JIS");

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<meta http-equiv="Content-Type" content="text/html; charset=Shift_JIS">

で良いと思います。

もしかして、ふと思ったんですが、元のテキストがEUC-JPじゃないとか

mb_convert_encoding($data,'SJIS', 'auto' );　にするとどうですか？

22pt

実際の文字コード、HTTP ヘッダと、HTML に書かれてる文字コードの違いがあるのではないでしょうか？

Content-type: text/html; charset=Shift_JIS\n\n

といったものはプログラムの中での出力です。

変換するときの、変換先文字コード指定

HTML に書かれてる文字コードの指定

HTTP ヘッダの文字コードを明確化

これらを見直してみてください。