UWSCを使って以下のコードを書きました。

EXCEL = GETACTIVEOLEOBJ("Excel.Application","Microsoft Excel - abc.xls")

というコードです。処理内容はA列のデータをB列に1行ずつコピーしていくという処理です。

1.abc.xlsを起動。
2.A列にデータを記入。
3.UWSC実行。
4.B列にデータをコピー
この処理は問題なく行うことができます。

ただ、複数のExcelを起動している場合。例えばxyz.xls、Book1.xlsなどのExcelが起動していたら、Book1.xlsを選択した時、Book1.xlsにA列の値がB列にコピーされてしまうという現象がおこってしまいます。

ヘルプを見ると、
戻値　=　GETACTIVEOLEOBJ( COMオブジェクト名,　[タイトル,　順番] )
引数
　　COMオブジェクト名：　COMオブジェクト名
　　タイトル：　複数時にタイトルで区別(一部でOK)
　　順番：　IEにてタイトルが同じ時に区別　　※IEのみ有効
戻値
　　COMオブジェクト

という内容が書かれています。GETACTIVEOLEOBJにタイトルとして、abc.xlsを指定しているのに、なぜ複数のexcelを起動している時に、abc.xls以外のブックにデータが書かれてしまうのでしょうか？これを回避するには何か方法があるのでしょうか？

GETACTIVEOLEOBJでは、Excelファイル名に関係なく、Excelオブジェクトが取り出されているようです。

特定のExcelに対して操作するには、Excel内で指定してあげる必要があります。

UWSCのサンプルからコーディングされていると思いますので、今は多分下記のようなプログラムになっていると思います。

EXCEL = GETACTIVEOLEOBJ("Excel.Application","Microsoft Excel - abc.xls")

With EXCEL.ActiveSheet
	for　y　=　1　to　5		// A列をB列へコピーのサンプル
		.Cells[y,2].Value　=　.Cells[y,1].Value
	next
EndWith

このプログラムだと、現在のアクティブなExcelに対して操作することになるので、指摘のようにBook1.xlsやxyz.xlsでも動いてしまいます。

対処方法として、３つあると思います。

案１．裏にあるExcelに対してそのまま操作する方法

案２．裏にいたなら、無理に表にしてしまう方法

案３．動かさずにエラーにしてしまう方法

どれを行いたいのか分からなかったので、３つ載せておきました。

//案１．裏にあるExcelに対してそのまま操作
EXCEL = GETACTIVEOLEOBJ("Excel.Application")

Workbook = EXCEL.WorkBooks("abc.xls")

With WorkBook.WorkSheets[1]
	for　y　=　1　to　5		// A列をB列へコピーのサンプル
		.Cells[y,2].Value　=　.Cells[y,1].Value
	next
	// .Range["B:B"].Value = .Range["A:A"].Value //全行ならこれでもOK
EndWith

//案２．裏にいたなら、無理に表にしてしまって処理
EXCEL = GETACTIVEOLEOBJ("Excel.Application")

EXCEL.WorkBooks("abc.xls").Activate
With EXCEL.ActiveSheet
	for　y　=　1　to　5		// A列をB列へコピーのサンプル
		.Cells[y,2].Value　=　.Cells[y,1].Value
	next
EndWith

//案３．動かさずにエラーにしてしまう
CONST FileName = "abc.xls"
EXCEL = GETACTIVEOLEOBJ("Excel.Application")

IFB EXCEL.ActiveWorkbook.Name <> FileName Then 
	MsgBox(FileName + "ではありません")
	EXIT
EndIF

With EXCEL.ActiveSheet
	for　y　=　1　to　5		// A列をB列へコピーのサンプル
		.Cells[y,2].Value　=　.Cells[y,1].Value
	next
EndWith

私もたまにUWSCを使います。

でも、今回の例のようにExcel主体であれば、UWSCよりWSHのほうが適しているような感じがします。