自社でアフィリエイトを行いと思っています。

アフィリエイターに認知してもらったうえで、掲載してもらう必要がありますが、プロモーション面は大丈夫なのでしょうか？

また、アフィリエイターの懸念点としては、トラッキングの公正さもあります。

直リンクアフィリエイトを売り物にしているASP(アフィリエイトサービスプロバイダー)もいるようですので、トータルで検討されてみたらいかがでしょうか？

osCommerceにはアフィリエイトモジュールがありますので、そちらをご利用されては如何でしょうか。

http://osc.ds-style.com/function/osCommerce_Affiliate.html

しかし、アフィリエイトシステムは肝心のアフィリエイターが集まらないと意味がありません。

なので、素直に大手ASPに出稿するのが吉かと思います。

一般的にアフィリエイトシステムを導入する目的は飽くまで「アフィリエイターに商品をセールスして貰う（営業を代行してもらう）こと」であって「アフィリエイターのウェブサイトからの被リンクでSEO効果を狙うこと」ではありません。

その辺り、「何のためにアフィリエイトシステムを導入するのか」を吟味して方法をお選びになられては如何でしょうか。

SEOによりトラフィック自体を伸ばしたいのであれば、素直に真っ当なSEOを行うのが吉かと思われます。