Adobe Photoshop CS4について質問です。

画像シーケンスとして書き出す事が可能ですので、そちらの機能を使用して保存してはいかがでしょうか？

http://help.adobe.com/ja_JP/Photoshop/11.0/WSC9CD6949-D63F-4299-...

Photoshop では、フレームアニメーションを画像シーケンス、QuickTime ムービーまたは別のファイルとして保存できます。 詳しくは、ビデオファイルまたは画像シーケンスの書き出しを参照してください。

http://help.adobe.com/ja_JP/Photoshop/11.0/WSB8B861CE-EBFB-4941-...

1. ファイル／書き出し／ビデオをレンダリングを選択します。

2. ビデオをレンダリングダイアログボックスで、ビデオまたは画像シーケンスの名前を入力します。

3. 「フォルダを選択」ボタンをクリックし、書き出されたファイルがある場所に移動します。

書き出したファイルを入れるフォルダを作成するには、「新規サブフォルダを作成」オプションを選択し、サブフォルダ名を入力します。

4. 「ファイルオプション」で「QuickTime 書き出し」または「画像シーケンス」を選択します。ポップアップメニューからファイル形式を選択します。

5. （オプション）「設定」をクリックして、ファイル形式に固有のオプションを指定します。

6. （オプション）手順 4 で「画像シーケンス」を選択した場合、開始番号と桁数を指定します（これらのオプションで、書き出されたファイルに番号を付ける方式を指定します）。書き出したファイルのピクセル寸法を指定するには、サイズポップアップメニューを使用します。

7. 「範囲」の下で次のいずれかのオプションを選択します。

すべてのフレーム

Photoshop ドキュメントのすべてのフレームがレンダリングされます。

インフレーム/アウトフレーム（タイムラインアニメーションのみ）

レンダリングされる一連のフレームを指定します。

現在選択しているフレーム

アニメーションパネルのワークエリアバーで選択されているフレームがレンダリングされます。

8. （オプション）レンダリングオプションを指定します。

アルファチャンネル

アルファチャンネルのレンダリング方法を指定します。 （このオプションは、PSD や TIFF などのアルファチャンネルをサポートする形式でのみ使用できます。）アルファチャンネルを無視する場合は「なし」を選択し、チャンネルを含める場合は「ストレート - マットなし」を選択し、マットカラーとカラーチャンネルを混合する場合は合成オプションのいずれかを選択します。

フレームレート

ビデオまたはアニメーションに毎秒作成されるフレームの数を決定します。「ドキュメントのフレームレート」オプションでは Photoshop のレートが反映されます。別のビデオ規格（例えば、NTSC から PAL）に書き出す場合、ポップアップメニューから適切なレートを選択します。

9. 「レンダリング」をクリックします。

※すべてのフレームを書き出す事も、選択したフレームだけを書き出す事も出来るようです。(手順7参照)

※ページ下部の「QuickTime 書き出しの画像シーケンスの設定」についても確認してみてください。