リカバリに備えてデータはオンラインのストレージにバックアップしてあります。インストールしたソフト等をバックアップしておくことはできますか。

Windows限定ですが、ドライブやパーティションを丸ごとイメージ化してバックアップできるソフト窓の杜 - EASEUS Todo Backupはどうでしょうか？

バックアップイメージをオンラインストレージにパックアップすれば良いかと。

バックアップイメージでＯＳ含めてリカバリしてから、データを復元する、と言う感じです。

下記のようなバックアップソフトを使い、アプリケーションがインストールされているドライブを丸ごとバックアップする必要があります。

HD革命/BackUp Ver.10

• 出版社/メーカー: アーク情報システム
• 発売日: 2010-06-11
• メディア: CD-ROM

HDDのデータを丸ごとコピーするソフトを使えば大丈夫だと思います。

その際に、コピー元のディスクのエラー情報も記録されてしまいますのでご注意を。

ただ、Windows XP以上を使っている場合はプリインストールされたものでない限りはライセンス認証を要求する可能性はあると思います(オンラインのストレージに保存するということなので多分その心配はないと思いますが)。