NPO法人の会計を弥生会計09で行っております。

それで正しいと思います

　余計なお世話ですが、ＮＰＯ法人の入会金・会費等で、入会申込書をＮＰＯ法人が受領した

時点で入会金の収入計上をしなければいけないですし、その月の会費が発生した時点で（会費

の発生を毎月１日とするとか、毎月月末日にするとか規定がありますか？）、未収入金計上す

ることが求められるでしょうから、お尋ねの普通預金に振込入金があった場合には、

（借方）普通預金１０，０００円（貸方）未収入金１０，０００円

とするのが正しいとは思います。

　さて、お尋ねの件ですが、未収入金計上しない方法をとると、

（借方）普通預金９、５８０円（貸方）入会金１０、０００円

（借方）支払手数料４２０円

となると思われます。（金額は適当です。）

もっとも、入会金収入の振込手数料をＮＰＯ法人側が負担する場合の処理であり、会員本人

に振込手数料を負担させるのであれば、

（借方）普通預金９，５８０円（貸方）入会金９，５８０円

となるのでしょうね。

　個人的には、ｎ対１又はｎ対ｎの複合仕訳で処理すると、勘定元帳を表示・印刷した

ときに、相手科目の表示が気に入らないので、１対１の単仕訳に分解して入力しています。

上の例だと、

（借方）普通預金１０，０００円（貸方）入会金１０、０００円

（借方）支払手数料４２０円　　（貸方）普通預金４２０円

という具合でしょうか。

振込手数料が御社負担というルールなら質問の通りで良いです

そうでなければ会員に振り込み手数料を請求したうえで

普通預金＝入会金　の金額が等しくなるようにしてください

振り込み手数料が未納である場合には

未納金として計上します

たぶんそれでいいと思いますよ