ディズニーランドのツアーパックで、沖縄から１０月～１１月以内の土日にミラコスタに２泊したいと思っています。（２泊３日）最もお得なのはどの会社のどのプランだと思いますか？

この様な質問をされる場合は、先ず
「旅行される方が何名なのか」という情報が必須でしょう。
また、とにかく「1円でも安くしたい」のか、それとも
ご質問者が「これだけは譲りたくない」という希望の条件をお持ちで
それと金額の兼ね合いになるのか、予算はどの程度なのか、
その辺りが明らかでないと回答しにくいですよね。

恐らくは、ご質問者は初めてのミラコスタのご宿泊かと思いますが
(違ったらゴメンナサイ)、ミラコスタは部屋タイプによって
眺望が全く異なりますので、最初にその選択をしておかれた方が
宜しいかと思います。ミラコスタ公式ウェブサイトをご参照下さい。
http://www.disneyhotels.jp/dhm/japanese/room/index.html

お奨め順は「ポルトパラディーゾサイド ハーバービュー」＞
「同サイド ピアッツァビュー」＞「ヴェネティアサイド」＞＞＞
「トスカーナサイド」です。「トスカーナサイド」は
料金が安くなっていますが、個人的には「ミラコスタに泊まるなら
トスカーナサイドは可及的に避けるべき」と思ってます。
但し、たまに「トスカーナサイド」の部屋だけ特別なオマケ
(オリジナルグッズプレゼント)等があったりしますけど。
上級の「スペチアーレルーム＆スィート」にするという手もありますが
該当するパックツアーが設定されていないんじゃないかと思いますが
確認はしてません。済みません。

国内ツアー検索総合サイトいくつかで検索してみた感じでは
「沖縄発往復航空券＋ミラコスタ宿泊」のパックツアーは
ANA系にはなくJAL系のみの様な感じでした。
総合サイトでの検索結果では、下記のJAL国内ツアー検索以上の結果が
得られなかった様に思いましたので
JALの検索サイトのアドレスのみお示しいたします。
http://www.jal.co.jp/domtour/
沖縄発、利用人数、3日間、キーワード「ミラコスタ」で検索すると
出発日が「10月日付未指定」の場合で13件、
「11月日付未指定」で11件ヒットします。
部屋タイプやパーク内レストランの食事等の有無で差別化されていますので
御自身のご希望と照らし合わせてお決め下さい。

ミラコスタのパックツアーを探されるのと平行して
「安宿のビジネス系パックツアー」(宿は利用しない)と
「ミラコスタの宿泊予約」を別に探してみられても良いのではないかと思います。
この方法であれば、ANA系の航空機も利用できます。