Googleアナリティクスについて詳しい方、教えてください。

おっしゃる通り各ページの訪問数はサイト全体の訪問数より小さいはずです。

「コンテンツ」 > 「サイト コンテンツ」 > 「すべてのページ」でセグメントしたページの「サイト全体に対する割合」が100%以上になっているのでしょうか？だとしたら不思議ですね。

関係ないかもしれませんが、「サイト全体の訪問数」という用語が気になります。現在Googleアナリティクスでは、「すべての訪問」が対応する用語だと思います。

あ、違うとは思いますが、同じタイトルの（セグメントのフィルターで一致する）ページが実は複数ある場合は、”そのページ”の訪問数がすべての訪問を上回ることはあり得ますね。

ひょっとしてこれではないですか？
http://www.ms321-co.com/blog/%E3%80%8C%E7%A7%81%E3%81%AFgoogle%E3%82%A2%E3%83%8A%E3%83%AA%E3%83%86%E3%82%A3%E3%82%AF%E3%82%B9%E3%82%92%E4%BD%BF%E3%81%88%E3%81%BE%E3%81%99%E3%80%8D%E3%81%A8%E8%83%B8%E3%82%92%E5%BC%B5%E3%81%A3-2/

5,ページビュー数、訪問数、ユーザー数の基本
一般的には「ユーザー数」＜「訪問数」＜「ページビュー数」の形になります。
例えば、1ユーザーがサイトを2回訪問し、合計で5ページビューを生成します。

ページビュー数が訪問数を超えているとあります

ページ別訪問数はいわゆるPV数の事です。別サイトから当サイトへ来たものを１、当サイトから当サイトへ飛んできたものを1とした合計です。

サイト別訪問数とは、別サイトから当サイトへ来たものを１、当サイトから当サイトへ飛んできたものを0とした合計です。

従って、サイト内からサイト内へのリンクが増えるようなコンテンツの場合は質問者さんの言う現象が起こります。

https://support.google.com/analytics/answer/1257084?hl=ja

こちらが参考になると思います。