私は、下に書いてあることを直したいんです。

潔癖症なんですね。きっと病気は怖い、きもちわるいとおもっているのでしょう、それはある意味では正しいです。
でも、今まで怖がらせるような知識ばかり得てそのままになっているようです。
大きくなったのだから、さらに詳しくて正しい知識をもたないといけません。
バイキンは地上最強ではありません。小さくて弱い生き物です。たとえばたいていの種類は太陽の光（UV）で死にます。
つばまでいちいち気にしていたら世の中をこわがったままいきていかなければならないので、いろいろと困ります。将来、恋人ができても歯ブラシをつかっては気持ち悪いというのでは、逆に歯が虫歯だらけの人としかつきあえなくて困りますね。
http://keepsmile.info/infect.html
などをよんで、キシリトールガムを噛むなど、それぞれの正しい対処法をいろいろしらべたら、怖くもきもちわるくもなくなるのではないでしょうか。
あとは、除菌もできるファブリーズなどを身の回りでつかってみればいいとおもいます。
あと、「もやしもん」を読むといいですよ。あなたのような人が大学生になった場合の話もでてきます。

　あくまで個人的な意見ですが、「強迫性障害の不潔恐怖」に該当する可能性があると感じました。
　◆強迫性障害 - Wikipedia ：
http://ja.wikipedia.org/wiki/%E5%BC%B7%E8%BF%AB%E6%80%A7%E9%9A%9C%E5%AE%B3
　◆潔癖 - Wikipedia ：http://ja.wikipedia.org/wiki/%E4%B8%8D%E6%BD%94%E5%BC%B7%E8%BF%AB

　例を上げて頂いた分の上半分などは、よく聞く事ですし「ああ、そう言う人もいるよね」とありますが、「他の人が歯磨きをしているのを見ると気分が悪くなる」というのは、日常生活、特に修学旅行などの団体行動をしたりなどの折りや、将来家庭を持つようになると辛いと感じる部分かと思います。

　個人的には、心療内科等で相談して欲しいと思います。質問者さんの諸症状について最終的な判断をするのは、あくまでも医師ということです。自分の見解はあくまで素人のものです。できれば早い内に心療内科などで診察をうけてみてはと思います。

id:Kaoru_A

一年くらい、そんな時がありました。放って置いたら収まりました。