はてなproを使っていますがサブアカウントはpro使用では使えないのですか？広告表示をけしたりとか、IDを消したりとかです。

「はてなpro」ではなく「はてなブログPro」のご質問という前提で。

サブアカウントでもプロの機能を使うには、新たにプロの申し込みをしなければならないようです。

Q. はてなブログProをメインアカウントで申し込めばサブアカウントでも有効になりますか？

A. 申し訳ございませんが、はてなブログProはアカウントごとのお申し込みとなっておりますので、それぞれのアカウントで別々にお申し込みください。

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サブアカウントで申しこめば新たな料金が発生する、というのは言うまでもないでしょう。