同一キーワードが出たら累計をカウントしてかつその数字とキーワードを合わせた文字列をセルに入れたい

5万行もあると、計算式では重くなりそうなので、マクロの場合も。

標準モジュールに以下のコードを貼り付けて、カウントしたいシートで countup_keyword サブルーチンを実行してください。

Sub countup_keyword()
    word_col = 25       ' Y列
    count_col = 26      ' Z列
    keyword = "バナナ"
    
    last_row = Cells(Rows.Count, word_col).End(xlUp).Row

    n = 0
    For r = 2 To last_row
        If Cells(r, word_col).Value = keyword Then
            n = n + 1
            Cells(r, count_col).Value = keyword & n
        End If
    Next
    
End Sub

Y列の値が "バナナ" と一致する場合に、同じ行の Z列に "バナナ" + 出現した数を埋めていきます。

部分一致の場合には、For 文の中の If 文の判定を変えます。

    For r = 2 To last_row

'       If Cells(r, word_col).value = keyword Then      ★部分一致にするには、ここを変更します
        If InStr(Cells(r, word_col).Value, keyword) > 0 Then
            n = n + 1
            Cells(r, count_col).Value = keyword & n
        End If
    Next

完全一致でやる場合よりも、遅くなります。

そして、隣のZ列はほとんど空白セルが並んでいる状態です。
Y列のセルが空白セルの場合は、隣のZ列のセルも空白セルでよいです

この扱いがちょっと分かりませんでした。
Y列が "バナナ" ではない場合には、Z列をそのままにしてあります。
空白に置き換えた方が良いのかもとは思ったのですが、Z列に何らかの値が入っていそうなので。

ただ、こうしてしまうと、Y列の値が変わったときに、昔の Z列の値がそのまま残ってしまう、という問題が出てきます。
一発動かして Z列に値が抽出できればお役御免、ということであれば問題ないと思いますが。