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寺の中の神社とは、①神仏習合の名残ですか？　つまり、もともとは、寺のご本尊の化身としての神社だったんでしょうか？　・・・廃物毀しゃくを辛うじて逃れたものが再建されたものでしょうか。

それとも、②お寺を作る際の、土地の神様を祀ったものでしょうか？　お寺の境内のため、土地をお借りしますという意味で。・・・この場合も、廃仏毀しゃくでは一度破壊されたのを修復したものなんでしょうか。

どちらでしょうか。それとも、両方でしょうか。或いは、ぜんぜん別の事情でしょうか？