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Macromedia Flash Player 6から仕様が変わってユニコードが基準になってしまいました。そのため、プレーヤー5との互換性が取れていません。
ただ、この仕様変更の副次的な要因だと思うのですが、奇っ怪な文字化けを経験したことがあります。外部テキスト処理やXML処理で発生します。ユニコード絡みだと思うのですが、理由がわかりませんでした。解決としては、SJISかUTF-8かのコンバートをやめて統一することでした。
ありがとうございました。
無事解決しました。