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リン酸化チロシンの280nm付近におけるモル吸光係数;molar extinction coefficient が知りたいのですが、その値が示してあるサイトもしくはその値を明示している論文がわかるサイトを教えてください。

●質問者: naotonaoton
●カテゴリ:科学・統計資料
✍キーワード:サイト チロシン リン酸化 論文
○ 状態 :終了
└ 回答数 : 3/3件

▽最新の回答へ

1 ● くまっぷす
●50ポイント

http://omlc.ogi.edu/spectra/PhotochemCAD/abs_html/tyrosine.html

Molar Extinction of Tyrosine

これでしょうか。

0.1Mのリン酸緩衝液下(pH=7)の条件ですけど、ちょっと違いますかね?

280.00nm で 1209(Moles-1cm-1)

http://www.globalpeptide.com/helpexco.html

Global Peptide Services, LLC: Extinction Coefficient

こちらは1280(Moles-1cm-1)

◎質問者からの返答

どうもです。えっと、知りたいのは、チロシンの吸光係数ではなくて、側鎖がリン酸化されたチロシン;phosphotyrosineの吸光係数なのです。


2 ● autismlike
●50ポイント

http://www.ncbi.nlm.nih.gov/entrez/query.fcgi?cmd=Retrieve&d...

Entrez PubMed

Pept Res. 1992 May-Jun;5(3):156-60.

アブストラクトしか読んでいないので、そのものズバリの情報があるかどうかは分かりませんが、アブストを見る限り内容がかなり近いので、参考になるのではないかと思います。

もしかしたらズバリの論文を孫引きすることができるかもしれません。

ちなみに検索キーワードは、tyrosine phosphorylated absorbance です。

◎質問者からの返答

有り難うございます。調べていただいたPept. Res.を読み、さらにその論文を引用している論文をWeb of Scienceであたってみたところ、PNASに264nmでの値が記載されているものがあり、非常に参考になりました。ただ、少し280nmから離れすぎているのでできればよりズバリなものが見たいというのが本音です。それと、Pept. Res.の論文には具体的な数値が挙げられていないのに、どうやってPNASの著者は値を決定出来たのかという疑問が残りました。Pept. Res.のデータをみただけでは吸光係数は出せないはずだし、他の論文を引用しているわけでもないのに、、、そのような他の論文というのが存在すれば、それがズバリのもののはずなのですが。。


3 ● autismlike
●50ポイント

http://dummy/

ご返答ありがとうございます。興味深く読みました。


もしかしたら、化学便覧などの基礎物性データ集(本)に、それらの吸光係数が載っているのかもしれません。手元に便覧が無いので調べられませんが、可能性は高いように思います。(そうだとしても元の論文が引けないのはおかしいですが、そういうこともあるのかもしれません)

すでに調べていたらごめんなさい。


おそらくタンパクかペプチドの研究をなさっているのだと思いますが、本当にその値がどうしてもどうしても真剣に必要なら、リン酸化チロシンを試薬として購入し、吸光係数を測るという手もあります。売っていればそれを使うか、あるいはリン酸とチロシンで合成するか...あまりお勧めできないですけどね。

http://www2.kanto.co.jp/catalog/search/CSearch.cfm

関東化学 試薬オンライン検索

検索するとそれらしいものが引っかかりますが、購入前にメーカーに確認した方が良さそうです。

http://pub.maruzen.co.jp/sipecshop/search/fRLB307315.html

????y?[?W????????????B

合成の専門書

◎質問者からの返答

実のところ、ケミカルとしてのphosphotyrosineは手元にあるので、実測するという方法は私も考えたのですが、できれば文献的な裏付けが欲しいと思いこのような質問をさせていただきました。いろいろ調べていただき有り難うございました。

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