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とある遺伝子の研究のためバイサルファイトシークエンスをしていますが、実際の領域の配列と、シークエンス結果との照らし合わせ方がわかりません。
シークエンスはABI310を使用しています。
分子生物の知識ゼロでもわかりやすいサイト、あるいは教えてくださる方がいましたらお願いします。

●質問者: shinlly
●カテゴリ:コンピュータ 科学・統計資料
✍キーワード:とある クエ サイト サルファ シーク
○ 状態 :終了
└ 回答数 : 2/2件

▽最新の回答へ

1 ● arakai
●35ポイント

バイサルファイトシークエンスとは良く知りませんが、

ClustalXで、普通にアラインメントをするのではだめでしょうか?

使用方法は以下のとおり。

http://w3pharm.u-shizuoka-ken.ac.jp/~bisei/text/research/Gen...

http://bips.u-strasbg.fr/fr/Documentation/ClustalX/

実際の配列はDDBJなどで検索してください。

http://www.ddbj.nig.ac.jp/


2 ● reje55
●35ポイント

同じ研究室の方にオススメのソフト等を含めて聞くのが

手っ取り早いと思うのですが・・・。


・アライメントとは

http://weblearningplaza.jst.go.jp/cgi-bin/user/top.pl?next=C...

このサイトの「バイオインフォマティクス?配列解析手法の原理」などを参照してください。


遺伝子のアライメントが出来るソフトはたくさんあります。

研究室で採用されているものを使用してみてはいかがでしょう?

Windowsのフリーの遺伝子解析ソフトというものが存在します。


BioEdit

http://cse.fra.affrc.go.jp/ksaitoh/BioEditTutorial.html

こちらなどを参考にしてください。

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