大量なデータですね。聴かないものは削除してデータ量を減らすことを一番オススメしたいのですが…
itunesはインポートする際にフォルダにアーティスト名などをふっていきますから、複数画面を持つファイラーが管理には便利かもしれません。windows用ですが、mebiusboxなどはいかがでしょうか?
http://mebiusbox.crap.jp/software_mebiusbox.html
音楽ファイルの管理に特化していないと厳しいようですねー
管理ソフト
http://www.forest.impress.co.jp/article/2007/06/26/yamipod.html