http://tenere.cocolog-nifty.com/log/2005/09/tw_6a4e.html
バッテリーが弱っているんじゃないかと思いますが?
もしくはバッテリーを外したスカチューンで発電容量が不足しているのでは?
エンジン回転が安定しない(低速、アイドリング)
http://moto.sakoma.net/kaizou/troubleshooting.htm#3
経験あります。
アイドリング時の回転数が低いことが考えられます。
アイドリング時の回転数を規定値に設定しましょう。
単車は普通は1000?1200くらいです。
参考になれば幸いです。