東京都でいくなら、かなりありそうですね。
取りあえずおもいつくところを上げます。
http://local.goo.ne.jp/tokyo/shopID_adeos-ADPL0813013/
昭和記念公園こもれびの里
割とひんぱんに農業体験をやってます。春になれば収穫体験の日が結構でてくると思います。収穫体験程度なら安価、手軽、ほぼ手ぶらでいけます。(植える方が大変ですが)
東京の西部(多摩地区)ならこういう体験型農園がいくつか存在します。
http://www.geocities.jp/koyama_nouen/
http://blogs.yahoo.co.jp/koyama_nouen/
ただちょっと敷居は高いですね。 たまに地域ボランティアで農家の収穫だけ体験させてくれることもありますが、地元のNPOとかが主催している小さいイベントのため、すぐには検索にはかかってきませんでした。
体験農業ではないですがここはお勧めです。
http://sakanaen.at.infoseek.co.jp/
さかな園
ぎりぎり東京都、ですよね。秋川渓谷の奥にあり、清流の中でバーベキューができます。恐らく地元の方がやっておられるようで、施設そのものはけっこうぼろっちいですがそれが味があります。川原もあんま整備されてなくて川遊びや虫とりなんかも自由にできます。車があればいいですが、面白い形のバスが武蔵五日市駅から出ているのでアクセスも問題ないです。
こちらはいかがでしょうか
http://www.fu-ta-ba.jp/trial/index2.html
陶芸体験
http://travel.biglobe.ne.jp/family/theme/tokyo_05_01.html
子供とミュージアム&体験スポット(東京都)