ファイルディスクリプタ数の制限は、このツールでできるようです。
http://www.codeproject.com/KB/system/File_Descriptor_Limit.aspx
Windows Serverには、Windows System Resource Managerというものがあり、様々な制限ができるようですね。
http://technet.microsoft.com/en-us/library/cc755056.aspx
普通のWindows用のこの種のツールは見つけられませんでした。
ありがとうございます。