Appleのサポートコミュニティにもこんな↓スレッドが有りますが、根本の原因は良く判らないようです…。
https://discussionsjapan.apple.com/message/100525955
根本的な対策では無いですが、対処療法として私は以下のソフトを使っています。
使い方は、アイコン位置を記録するか復帰するかのボタンをクリックするだけです。