HDDのパーティションを操作するfdiskコマンドと
コピーコマンドの1つであるddコマンドを身に付ければ可能ですが、
このような質問をしているスキルでは操作失敗も十分にありうると思いますので、
HDDには新規でXubuntuをインストールして、
必要なデータだけをSDメモリからコピーするのが無難でしょう
わかりました