ﾌｧｲﾙ変換(ELFﾌｧｲﾙ)･もしくは､何かしらのﾌｧｲﾙ変換ﾂｰﾙが必要なのでしょうか？
一応､objcopyと言うのがあって､変換できるようです｡
objcopy -O sh-hitachi-elf hoge.bin hoge.elf
*.elfがほしいのですが､その手順をご教授ください｡
Makefileが*.elfを作れるようになっているなら､
make hoge.elf
などで､hoge.elfが作られるはずです｡
ただ､質問にあるﾘﾝｸ先のﾍﾟｰｼﾞを読むと､sh-hitachi-elfってあるので､そのままでelf形式になってる気がするんだけど｡
出来ているﾌｧｲﾙをreadelfやobjdumpで見てみたらどうでしょうか？
readelf -h hoge.bin objdump -f hoge.bin
参考
･Makefileを書き換える必要があるのでしょうか？
前記の方法で出来ないなら､たとえばgccのｵﾌﾟｼｮﾝに｢-b sh-hitachi-elf｣を付けるなど､書き換える必要があるのかもしれません｡
しかし､ｸﾛｽｺﾝﾊﾟｲﾙ環境なわけですし､configureでつけてくれる気がするのだけど､もしかしたらconfigureにｵﾌﾟｼｮﾝがあるのかもしれません｡
あと､ﾘﾝｶがelfを出力するように｢-Wl,--oformat,elf32-hoge｣と付ける手もあるかもしれませんが､それでまともに動くのかはしりません｡
｢elf32-hoge｣というのは実際にはobjdump --helpに出てくる一覧の内の一つで､一口にelfと言っても色々あるらしいです｡
参考
また､これらﾌｧｲﾙ群(*.bin､*.exe､*.syms､そして*.bin､他)の
意味､使用ｹｰｽを紹介したｻｲﾄがあれば､合わせて教えてください｡
*.binは一般にﾊﾞｲﾅﾘﾌｧｲﾙを表します｡ここではflashROMに書き込むﾌｧｲﾙとなるようです｡
*.exeは一般にDOS/Windowsの実行ﾌｧｲﾙを表します｡しかし､今回のがWindowsで実行できるかは知りません｡たんにPE形式のﾌｧｲﾙと言うだけかもしれません｡
*.symsはおそらくﾃﾞﾊﾞｯｸﾞ用のｼﾝﾎﾞﾙﾌｧｲﾙだと思われます｡
[追記]
ふと気が付いたのですが｢最終的にできたﾌｧｲﾙ｣というのは
ですか？だとしたら､jsp.exeはToppers/JSPｴﾐｭﾚｰﾀのような気がします｡
TOPPERS/JSPは標準でELF形式のﾌｧｲﾙを出力するようになっていますので，Makefileを変更せずにﾋﾞﾙﾄﾞを走らせて生成したjspがELF形式のﾌｧｲﾙになります．
bin,exe,symsのﾌｧｲﾙ形式についてはTransFreeBSDさんが説明されている通りです．
他にもsrec(Sﾚｺｰﾄﾞ)形式にする場合などもあります．
