お好きなサイズに設定すればいいですよ。
DSiで撮れる画像のサイズは640×480ピクセルですが、設定を長辺640ピクセル未満にすれば縮小されます。一方、641以上に設定しても拡大はされず、元のサイズでアップロードされます。