総務省のサイトに、一覧が PDF でありました。
http://www.soumu.go.jp/main_sosiki/gyoukan/kanri/pdf/satei2_01_03.pdf
平成23年11月1日現在で、102法人とのことです。
先程の一覧は、ここのページから引っ張ってきています。
http://www.soumu.go.jp/main_sosiki/gyoukan/kanri/satei2_01.html
特定独立行政法人の常勤職員数などのデータもあるようですので、参考まで。
総務省のこちらのページでは、独立法人のサイトへのリンクがあります。
http://www.soumu.go.jp/main_sosiki/hyouka/dokuritu_n/dokuhou_ichiran.html
http://www.soumu.go.jp/main_sosiki/gyoukan/kanri/pdf/satei2_01_03.pdf
102法人ありますね。
http://ja.wikipedia.org/wiki/%E6%97%A5%E6%9C%AC%E3%81%AE%E7%8B%AC%E7%AB%8B%E8%A1%8C%E6%94%BF%E6%B3%95%E4%BA%BA%E4%B8%80%E8%A6%A7
こちらもご参考まで。
105法人です。
http://www.soumu.go.jp/main_sosiki/hyouka/dokuritu_n/dokuhou_ichiran.html
全102法人(2011年11月1日現在)
うちわけは
特定独立行政法人(8法人)
非特定独立行政法人(94法人)