Acrobat(Reader ではない) を持っているのなら､一度 Acrobat から各ﾍﾟｰｼﾞを画像として書き出し､
それをPhotoshopなどの自動処理か可能なﾂｰﾙで処理し､
奇数ﾍﾟｰｼﾞだけを Acrobat に取り込み直すというかんじでしょうか｡

Acrobat だけでもできないことはないと思いますが､
各ﾍﾟｰｼﾞが画像から取り込まれていると無理でしょう｡
自動化も難しいと思います｡

http://www.adobe.com/jp/products/acrobat.html