そもそもがマイクロソフトがMoneyのサポートを終了したのが原因のようで、同じように困っている人たちが変換プログラムを作っています。
ベクターで公開されているプログラム
http://www.vector.co.jp/soft/winnt/business/se363839.html?ds
そのプログラムを使った手順を公開している人のブログ
http://ameblo.jp/aginda3/entry-10813627140.html
(三井住友VISAでのパターン)
エクセルVBAを組んだ人もいるようです。こちらはオープンソースなので自分で中身の修正ができます。上の方法の方が簡単でしょうが、うまくいかないのなら試してみてもいいと思います。
http://www.yet-another-world.jp/hammer/csv2ofx.html
ちなみにMoneyそのものが販売・サポート終了しているため機能制限無償版「Money Plus Sunset Deluxe」日本語版なるものが公開されています。有償版のオンラインでのアクティベーションが使えなくなるための措置でもあるようです。
http://www.forest.impress.co.jp/docs/news/20110118_421021.html