OSとはhttp://e-words.jp/w/OS.html
コンピュータシステム全体を管理するソフトウェア
管理する事の一つに、出来る事と出来ない事、つまり権限を管理する事があります。重要な事は勝手に変更出来ないように、一般ユーザと管理者で権限が違います。同じようにOSと人も分けられていて、OSがOSのための作業にシステム権限が使われます。間違うとOSが確実にこわれてしまうような事は管理者権限でも制限されていて、システム権限が必要になっていたります。