ご質問の前提状況が分からないのですが､｢会社＝個人事業主｣ということであれば､借入金の利息は下記ｻｲﾄの通りに計上します｡
http://www.zei.vc/keiri/keiri-0017.html

貸主の個人事業(私)さんが借主の会社の社長でも役員でも社員でも利息をつけてもかまいませんわよ｡
でも決算でというところが引っかかるわ｡
税金をごまかす目的に見えてしまうのだけど､どうかしら？

銀行振り込みなんかで証拠残してある？
利息の話題を含んだ金銭消費貸借契約書は作成してある？
利息が二桁とか高すぎたりしてない？
事業資金として本当に必要だったと証明できる？

こんな感じで検索してみると私の回答の証拠になるかしら？
https://www.google.co.jp/search?q=%E5%BD%B9%E5%93%A1+%E5%80%9F%E5%85%A5%E9%87%91+%E5%88%A9%E6%81%AF

まだ先の話だけど着実に返しているという実績を残していくことも重要ね｡
http://www.smbc-consulting.co.jp/company/solution/accounting/accounting_678.html