はてなﾌﾞﾛｸﾞProなんですが､もともとある広告を非表示できる､っていうのはわかるんですが､そうしておいて､自分で広告を貼る､つまり､ｻｲﾄﾞﾊﾞｰや任意の場所に自分のG…

はてなﾌﾞﾛｸﾞの｢広告ﾎﾟﾘｼｰ｣として､下記のように明記されています｡

商用ｻｲﾄへの誘導や収益を得ることを主目的とした､はてなﾌﾞﾛｸﾞの利用を認めません｡
http://help.hatenablog.com/entry/guideline#ads_policy

これは｢はてなﾌﾞﾛｸﾞPro｣にも適用されますので､自分のIDで広告を貼ることはできないということになります｡

まず､混乱を除きましょう｡
http://www.hatena.ne.jp/info/affiliate

現在はてなでは､はてなﾌﾞﾛｸﾞ､はてなﾀﾞｲｱﾘｰ､はてなｸﾞﾙｰﾌﾟ､はてなｱﾝﾃﾅがｱﾌｨﾘｴｲﾄﾌﾟﾛｸﾞﾗﾑに対応しています｡

はてな利用規約では宣伝･広告行為を禁止していますが､ﾕｰｻﾞｰが有益な情報を得られたり有益なｻｰﾋﾞｽを受けられることから､広告を掲載し収入を得ることを許可しています｡

http://staff.hatenablog.com/entry/2012/10/31/171248

その他の機能追加
Google AdSenseのﾀｰｹﾞｯﾄとして記事の本文のみが使用されるようにしました｡
はてなﾌﾞﾛｸﾞにおいて､記事本文のみがGoogle AdSenseのｾｸｼｮﾝﾀｰｹﾞｯﾄとなるよう設定しました
記事の内容により適合した広告が表示されます
ﾃﾞﾌｫﾙﾄで表示されるAdSenseと､ﾕｰｻﾞｰさまが設置されたAdSenseと､ともに作用します
ﾕｰｻﾞｰさまで､設定の変更などを行っていただく必要はありません

ﾕｰｻﾞｰが設置されたAdSenseとあるので､設置できるのでしょう｡
しかし､質問者が言うようにｻｲﾄﾞﾊﾞｰに設置する方法は私には見つけられなかった｡
強引に設置したと書いているﾌﾞﾛｸﾞも見つけたが､設置を確認出来なかった｡
記事にはHTML編集をする事で下のように入れられる｡
ﾀﾞｲｱﾘｰでのｱﾄﾞｾﾝｽﾓｼﾞｭｰﾙは､はてなﾌﾞﾛｸﾞproでは機能しなかった｡
編集ﾓｰﾄﾞを､はてな記法ﾓｰﾄﾞにしても変わらず機能しない｡

ﾓｼﾞｭｰﾙに関しては､はてなﾀﾞｲｱﾘｰと完全に互換性があるとは言えないと思う｡
根拠を提示する事は面倒で嫌なので､やらない｡
他の回答者が言うように､AdSenseﾓｼﾞｭｰﾙを貼ってみたが有効にはならなかった｡
しかし､はてなﾌﾞﾛｸﾞは人力においてﾕｰｻﾞｰから､ﾓｼﾞｭｰﾙの提案を受け付けている時もある｡
なので今後､実装される可能性もあると思う｡

私の現時点での結論
ｱﾄﾞｾﾝｽを貼りたいときは､記事を編集する時にHTML編集を使うようにする｡
ｻｲﾄﾞﾊﾞｰに期待しない｡←これは間違い｡

ﾍｯﾀﾞ､ﾌｯﾀ､ｻｲﾄﾞﾊﾞｰ､記事にｱﾄﾞｾﾝｽを入れられることを確認しました｡