新規ユーザ(OSにログインするユーザではなく、Chromeの中にあるユーザ)を作成すると、ほとんどの設定が新規の状態で始まります。(「既定のブラウザ」設定なんかは新規にならないですね。)
作成する方法は下記のヘルプをご覧下さい。
(設定ファイルの削除などで完全にまっさらにする方法もあると思いますが、簡便な方法としてご紹介しました。)
Chrome で複数のユーザーを管理する - Google Chrome ヘルプ
https://support.google.com/chrome/bin/answer.py?hl=ja&answer=2364824