こんにちは。
iPhoneの連絡先はiTunesを使ってバックアップをしている人も多いですが、iTunesだと連絡先のみのバックアップが出来ませんし、本当にバックアップされているのか確認も出来ません。
自分のPC内にバックアップするのが最も安心です。私はバックアップソフトを使っています。
バックアップのほかグループ分けも出来るので管理ツールとしては使い勝手がいいです。
http://www.copytrans.jp/copytranscontacts.php
そのほかにもいろいろな方法があります。
http://a.know-how.fc2.com/ja/31645/
二重にバックアップしておくのがいいかもしれません。