HDDがAFT対応のものではありませんか?
http://www.pc-master.jp/jisaku/aft-hdd.html
だとするとフリーソフトで適当なものがないので、下記の市販ソフトを使ってみてください。
HD革命 CopyDrive Ver.5 with Partition EX2 Windows8対応 [ダウンロード]
この質問が一番症状に近いと思われます。
http://www.zqwoo.jp/sak_bbsq/show_c/117082
一度こちらから元のハードディスクに対して、ディスクチェックをかけてみてはどうでしょう?
http://trendy.nikkeibp.co.jp/article/tec/winxp/20021125/102905/?rt=nocnt