ﾙｰﾌﾟの処理で投稿を表示していますから､ﾙｰﾌﾟの開始直前またはﾙｰﾌﾟの処理終了後の箇所に記述するといいです｡

･ﾄｯﾌﾟﾍﾟｰｼﾞ｢index.php｣

<?php if ( have_posts() ) : ?><!-- 投稿の有無を判定 -->

<?php if (function_exists('page_navi')) :
page_navi('elm_class=page-nav&edge_type=span');
endif; ?>
<?php /* 以前の質問で削除済み？ */ /* twentyeleven_content_nav( 'nav-above' ); */ ?>

<?php /* Start the Loop */ ?><!-- 投稿表示のﾙｰﾌﾟ開始 -->
<?php while ( have_posts() ) : the_post(); ?>

<?php get_template_part( 'content', get_post_format() ); ?>

<?php endwhile; ?><!-- 投稿表示のﾙｰﾌﾟ終了 -->

<?php if (function_exists('page_navi')) :
page_navi('elm_class=page-nav&edge_type=span');
endif; ?>
<?php /* 以前の質問で削除済み？ */ /* twentyeleven_content_nav( 'nav-below' ); */ ?>

<?php else : ?><!-- 投稿が無い場合の処理 -->

※ｶﾃｺﾞﾘｰﾍﾟｰｼﾞおよびｱｰｶｲﾌﾞﾍﾟｰｼﾞにも同様のﾙｰﾌﾟ処理があるはずですので､上に表示する場合は｢if ( have_posts() ) :｣から｢while ( have_posts() ) : the_post();｣の間に､下に表示する場合は｢while ( have_posts() ) : the_post();｣に対する｢endwhile;｣の後に記述します｡

【※ｺｰﾄﾞ修正済み※】(PHPの開始ﾀｸﾞ･終了ﾀｸﾞ忘れ)