ｸﾞｯﾄﾞｼﾝｸと申されておるのはこちらのｿﾌﾄｳｪｱということでよろしいでしょうか｡
http://www.goodsync.com/jp/manual.html

簡単に申しますと二つのﾊﾟｿｺﾝをこのｿﾌﾄｳｪｱで接続しそれぞれのﾊﾟｿｺﾝのﾌｫﾙﾀﾞの中身を同じにしてくれるということでございます｡
接続する片方のﾊﾟｿｺﾝではﾌｧｲﾙを作成･更新･削除するような操作を行わない場合におきましてはもう片方のﾊﾟｿｺﾝの内容の写しが作成されるということでございますのでﾊﾞｯｸｱｯﾌﾟを行っているということになるのでございます｡

使い方は先程のﾏﾆｭｱﾙにございますように以下のような手順で実施致します｡

同期の手順
通常ｸﾞｯﾄﾞｼﾝｸのﾕｰｻﾞは以下の手順で同期を行います：
0. 同期を行いたいﾌｫﾙﾀﾞを選択する
1. 解析
2. ﾕｰｻﾞがｸﾞｯﾄﾞｼﾝｸの解析結果を確認する
3. 同期(ｼﾝｸﾛ)

常に複製を作成しておくには｢自動ﾀﾌﾞ｣というところから実施のﾀｲﾐﾝｸﾞを指定することで実現できるようでございます｡

説明書きを読んでもあまりﾋﾟﾝときませんが､要はVPNを構築するということでしょうか｡

接続の方法はいくつか選べるようでございますがVPNとは関係ございません｡
接続するﾊﾟｿｺﾝの種類やつなぎ方に応じて選ぶことになると存じます｡
つなぎ方と申しますのはふたつのﾊﾟｿｺﾝが遠隔地にある場合にはﾌｧｲﾔｰｳｫｰﾙなどを介して接続いたしますがその際に置いて一般回線を使用する場合には接続手段を制限するのが通例でございます｡
その場合には接続するために使えないﾌﾟﾛﾄｺﾙがございます｡
また一般回線では暗号化などの措置も必要かと存じます｡
このｿﾌﾄｳｪｱとは別にVPN回線を開いて暗号化するという方法もございますが接続方法にございます｢ｾｷｭｱFTP｣というものをお使いになれば通信手段で暗号化をすることが可能でございます｡

乱筆乱文でございますが理解の一助となれば幸いに存じます｡

GoodSyncは､SiberSystems社(ﾊﾟｽﾜｰﾄﾞﾏﾈｰｼﾞｬ『Roboform』の開発会社)の同期ﾂｰﾙで､

• WindowsとMac間で同期が可能です｡
• また､Google Docs/SkyDrive/Amazon S3､WebDAVといったFTPｻｲﾄやﾘﾑｰﾊﾞﾌﾞﾙﾄﾞﾗｲﾌﾞとの間での同期もできます｡
• さらに､ﾌｧｲﾙをいつどのように同期させるかについての様々な設定が可能｡
• 最新のGoodSync 9では､ﾘｰﾓｰﾄﾌｧｲﾙｱｸｾｽ機能と､ﾌﾞﾛｯｸﾚﾍﾞﾙ同期(更新ﾌｧｲﾙだけ同期)によるｽﾋﾟｰﾄﾞ同期機能が追加されています｡

http://www.lifehacker.jp/sp/2012/03/120326syncwithoutstore_2.html