私も以前使っていたﾌﾟﾘﾝﾀｰで同じようなことがあり､その時はしばらく使っていたらｲﾝｸの線が付かなくなりました｡

ﾛｰﾗｰに付いたｲﾝｸが全部印刷紙に付ききるか､自然乾燥したのだと思います｡

ですので使用済みでもういらないｺﾋﾟｰ用紙を使って､｢1｣など一文字を繰り返し印刷､もしくは手間はかかるのですが1枚のｺﾋﾟｰ用紙で繰り返し印刷をしてﾛｰﾗｰについたｲﾝｸを拭き取るのはどうかなと思います｡

ｸﾘｰﾆﾝｸﾞ機能はｲﾝｸのつまりを解消するものだったと思いますので､ﾛｰﾗｰに付いたｲﾝｸは残念ながらｸﾘｰﾆﾝｸﾞでは取り除けないはずです｡

他にいい方法が見つかりましたら追記いたしますね｡


追記です｡
すいません､なぽりんさんのおっしゃるようにｲﾝｸの拭き取りｸﾘｰﾆﾝｸﾞもあったのですね｡
申し訳ないです｡

写真で拭き取り方を紹介しているのがありましたのでお伝えしますね｡
http://ascii.jp/elem/000/000/096/96331/index-2.html
横線･縦線のｲﾝｸ汚れの掃除のしかたが載っています｡


http://gigahertz.blog70.fc2.com/?mode=m&no=167
Canon複合機の解体をされているのがありました｡
写真で見る限りではとても複雑ですので外して拭き取るのは難しそうです｡

http://10razo.blog137.fc2.com/blog-entry-329.html
Canon MP800の分解 ｽｷｬﾅｰ部の取り外しまで
http://10razo.blog137.fc2.com/blog-entry-332.html
Canon MP800の分解 吸収体まで
組み立てでしくじって使えなくなってしまったようです｡

http://z0001.blog87.fc2.com/blog-entry-76.html
ｷｬﾉﾝiP4500の解体
こちらも複雑そうですので外して拭き取るのは難しそうです｡

http://cweb.canon.jp/manual/mp/mp800/mp800-ug1-ja-v2.pdf
の101頁にあるA4紙を折って入れて行う｢ｲﾝｸ拭き取りｸﾘｰﾆﾝｸﾞ｣を行ったけれど治らなかったのですか？そのあとの突起の綿棒による掃除も行ったのでしょうか？

上記のように『 ｲﾝｸ拭取りｸﾘｰﾆﾝｸﾞ 』を何度か繰り返すのが効果的と思います｡
私も黒い筋が入ると実行しています｡

それでも､症状が続くようなら､『 ﾛｰﾗｰ部分を麺棒などで直接拭き取る 』様にしています｡

是非試してみてください｡

ｲﾝｸふき取りｸﾘｰﾆﾝｸﾞを行う
http://cweb.canon.jp/e-support/faq/answer/inkjetmfp/44894-1.html

http://cweb.canon.jp/e-support/faq/answer/inkjetprinter/51119-3.html

ｲﾝｸ拭き取りをするのはどうでしょうか｡